O HMSJ possui uma estrutura física preparada para ser considerada a melhor maternidade da região Central – Norte do Estado. Possui um Novo centro de parto normal com 10 leitos e uma sala cirúrgica exclusiva para o setor. Possui também um total de 22 leitos de alojamento conjunto, 01 banco de leite e 01 casa de gestante, neonato e puerpério.

A equipe conta com 02 médicos obstetras plantonistas, enfermagem especializada em Obstetricia, pediatra, anestesiologista e fisioterapeutas durante as 24 horas, com o objetivo de assistir a gestante e o recém-nato. Pela excelência no atendimento, o HMSJ possui convênio com a universidade UNESC, sendo um grande polo de aprendizado continuo, com a presença de alunos do curso de medicina dos últimos anos de faculdade e de médicos em especialização na área de Ginecologia e Obstetricia. A porta de entrada para a gestante é a recepção, com funcionamento 24 horas, onde é feito o registro em prontuário e então encaminhamento para o atendimento com obstetra e avaliação para admissão, a continuidade do atendimento se dá no pré-parto, sala de parto ou ambulatório.

A visita da maternidade é livre ao pai do neonato e a gestante tem direito a um acompanhante de livre escolha durante toda sua internação.